Commercialista per farmacie e società titolari di farmacia

Cosa facciamo per una farmacia e per la società che la possiede

Una farmacia ha due casse: il banco, dove il cliente paga, e il Servizio sanitario, che paga a fine mese le ricette con la distinta contabile riepilogativa. Dal 2024 la seconda cassa funziona con regole nuove, e dal 2017 la farmacia può essere di una società con soci che non sono farmacisti. Sono due cambiamenti che hanno reso la contabilità della farmacia molto più vicina a quella di un'azienda vera e propria.

Per le farmacie seguiamo:

• la contabilizzazione mensile della distinta con la nuova remunerazione, quote fisse e IVA comprese;
• corrispettivi del banco, aliquote IVA tra farmaci e parafarmaco, rapporti con il Sistema Tessera Sanitaria;
• contabilità ordinaria, bilancio e imposte della società titolare;
• l'ingresso e l'uscita dei soci, con le verifiche di incompatibilità e le comunicazioni agli enti;
• acquisto e vendita della farmacia, dalla valutazione alla fiscalità dell'avviamento e della plusvalenza.

Il codice ATECO 2025 della farmacia è il 47.73.10, commercio al dettaglio di medicinali soggetti a prescrizione. Le note Istat assegnano a codici diversi integratori, articoli medicali e cosmetici venduti in negozi specializzati: in farmacia restano attività accessorie, ma pesano sull'IVA del banco.

La nuova remunerazione SSN: cosa entra nella distinta e con che IVA

Fino a febbraio 2024 la farmacia tratteneva il 26,7% del prezzo al pubblico netto IVA e riconosceva al Servizio sanitario uno sconto a scaglioni, dal 3,75% al 19% secondo il prezzo del farmaco. Dal 1° marzo 2024 la legge di bilancio 2024 (L. 213/2023) ha fatto cessare lo sconto proporzionale, salvo i medicinali originariamente coperti da brevetto, e ha introdotto una remunerazione composta da:

• una quota variabile del 6% sul prezzo al pubblico al netto dell'IVA;
• quote fisse per confezione: 0,55 euro fino a 4 euro di prezzo, 1,66 euro tra 4,01 e 11 euro, 2,50 euro oltre 11 euro;
• una quota per i farmaci delle liste di trasparenza, portata a 0,115 euro dal 2025;
• quote aggiuntive per le farmacie con fatturato SSN basso: 1,20 euro fino a 150.000 euro, 0,58 euro fino a 300.000 euro, 0,62 euro per le rurali sussidiate fino a 450.000 euro.

L'IVA sulle quote

Con la consulenza giuridica n. 5 del 20 giugno 2025 l'Agenzia delle Entrate ha chiarito che le quote, fisse e aggiuntive comprese, sono il corrispettivo della cessione del farmaco al Servizio sanitario: scontano l'IVA al 10% del n. 114 della Tabella A, parte III, come il medicinale. Trattarle come somme fuori campo IVA è un errore che si ripete su ogni distinta.

Il fatturato SSN per le soglie

Per stabilire se la farmacia ha diritto alle quote aggiuntive conta il fatturato SSN al netto dell'IVA, che comprende i farmaci ceduti in regime SSN, la remunerazione della distribuzione per conto, l'assistenza integrativa e protesica e i ticket (art. 1, comma 40-bis, L. 662/1996). Dimenticare la DPC nel conto fa sembrare la farmacia più piccola di quello che è.

Un'altra precisazione dell'Agenzia (risposta n. 107/2024): la remunerazione aggiuntiva riconosciuta per il 2023 non è un contributo emergenziale detassato, ma concorre al reddito e alla base IRAP secondo le regole ordinarie.

Distinta contabile riepilogativa, DPC e tempi di incasso

Secondo l'accordo nazionale reso esecutivo con il DPR 371/1998, la farmacia consegna le ricette e il documento contabile entro il 5 del mese successivo a quello di spedizione, con le modalità concordate in Regione; l'ASL paga entro l'ultimo giorno del mese. Un ritardo nella consegna sposta l'incasso di un mese. La legge di bilancio 2026 richiama il nuovo accordo collettivo nazionale delle farmacie, oggetto di intesa il 6 marzo 2025: i termini applicati in ciascuna Regione vanno verificati sul testo regionale in vigore.

Le Regioni possono anche affidare alle farmacie la distribuzione per conto (DPC) dei medicinali che richiedono un controllo ricorrente del paziente (art. 8 D.L. 347/2001): la farmacia consegna farmaci acquistati dall'ASL e riceve una remunerazione per il servizio, che va registrata e conta per le soglie di fatturato.

Farmacia dei servizi

Con la legge di bilancio 2026 (L. 199/2025) i servizi resi dalle farmacie ai sensi del D.Lgs. 153/2009, come prestazioni di prima istanza e servizi di telemedicina, sono stabilmente integrati nel Servizio sanitario, con 50 milioni di euro l'anno dal 2026 e remunerazione definita negli accordi regionali. Sono ricavi nuovi, con un loro trattamento contabile e fiscale: conviene tenerli in conti separati fin dal primo incasso.

Il banco: farmaci al 10%, parafarmaco e corrispettivi

Al banco convivono aliquote diverse. I medicinali pronti per l'uso, compresi gli omeopatici, sono al 10%; molto parafarmaco segue l'aliquota ordinaria del 22%, salvo i prodotti che rientrano in una voce delle tabelle. L'art. 24 del DPR 633/1972 prevede, per chi vende beni ad aliquote diverse e ne ha l'autorizzazione, la ventilazione: i corrispettivi si ripartiscono tra le aliquote in proporzione agli acquisti.

I corrispettivi si memorizzano e si trasmettono ogni giorno (art. 2 D.Lgs. 127/2015). Chi invia i dati al Sistema Tessera Sanitaria per la dichiarazione precompilata può assolvere l'obbligo trasmettendo tutti i corrispettivi a quel sistema. Dal 1° gennaio 2026 il terminale di pagamento deve essere collegato al registratore.

Lo scontrino che serve al cliente

Per detrarre il 19% della spesa per medicinali, il cliente deve avere una fattura o uno scontrino con natura, qualità e quantità dei beni e il suo codice fiscale (art. 15 TUIR). Non gli serve invece pagare con carta: l'obbligo di pagamento tracciabile non si applica a medicinali e dispositivi medici (L. 160/2019, comma 680).

Società titolare: soci, incompatibilità e limite del 20%

La legge 124/2017 ha riscritto l'art. 7 della legge 362/1991. Oggi possono essere titolari di farmacia persone fisiche, società di persone, società di capitali e cooperative a responsabilità limitata. Le regole per la società sono precise:

• oggetto esclusivo: la società deve avere come unico oggetto la gestione di una farmacia;
• direzione: la farmacia è diretta da un farmacista con il requisito dell'idoneità, che ne risponde, anche se non è socio;
• incompatibilità dei soci: la partecipazione è incompatibile con attività di produzione e informazione scientifica del farmaco, con la professione medica, con la posizione di titolare, direttore o collaboratore di un'altra farmacia e con qualsiasi rapporto di lavoro pubblico o privato;
• comunicazioni: statuto e ogni variazione, comprese quelle della compagine sociale, vanno comunicati entro 60 giorni alla Federazione degli Ordini dei farmacisti, alla Regione, all'Ordine provinciale e all'ASL.

Le violazioni portano alla sospensione del farmacista dall'albo per almeno un anno. Per questo ogni cessione di quote passa da una verifica dei requisiti del nuovo socio, e l'operazione è seguita dalle comunicazioni agli enti e dall'aggiornamento del titolare effettivo.

Gruppi di farmacie

Nessun soggetto può controllare, direttamente o indirettamente, più del 20% delle farmacie della stessa regione o provincia autonoma (art. 1, comma 158, L. 124/2017), con la vigilanza dell'Autorità garante della concorrenza. Un gruppo che cresce per acquisizioni deve contare le farmacie controllate anche tramite le società partecipate, prima di firmare. Le riorganizzazioni di gruppo passano spesso per una fusione tra le società titolari.

Comprare o vendere una farmacia: pianta organica, avviamento e plusvalenza

Il numero delle farmacie è fissato dalla pianta organica: una ogni 3.300 abitanti, con una farmacia in più se la popolazione eccedente supera il 50% del parametro, e una distanza minima di 200 metri dalle altre (art. 1 L. 475/1968). La revisione si fa entro dicembre di ogni anno pari. È il motivo per cui una farmacia ha un avviamento alto: il numero di sedi è limitato dalla legge.

Le regole del trasferimento

La titolarità si può trasferire decorsi tre anni da quando è stata conseguita, e il trasferimento non è valido se insieme al diritto di esercizio non passa anche l'azienda commerciale collegata (art. 12 L. 475/1968).

Chi compra

Nell'acquisto dell'azienda l'avviamento iscritto in bilancio si deduce in misura non superiore a un diciottesimo l'anno (art. 103 TUIR). Su un avviamento di 1.800.000 euro sono 100.000 euro di quota deducibile annua, per diciotto anni. Il piano del finanziamento va costruito tenendo conto di questo ritmo, perché le rate del mutuo corrono più veloci della deduzione.

Chi vende

La plusvalenza sulla cessione di un'azienda posseduta da almeno tre anni può essere tassata, a scelta, in quote costanti nell'esercizio della vendita e nei successivi, fino al quarto (art. 86 TUIR). Una plusvalenza di 900.000 euro può così essere distribuita in cinque quote da 180.000 euro.

Una confezione da 11 euro: chi prende cosa

Il calcolo segue l'esempio della consulenza dell'Agenzia delle Entrate n. 5/2025. Un farmaco con prezzo al pubblico di 11 euro IVA compresa ha un prezzo netto di 10 euro.

Alla farmacia restano 2,26 euro per confezione. Se il fatturato SSN non supera 150.000 euro si aggiungono 1,20 euro e il corrispettivo sale a 10,43 euro. Moltiplicato per decine di migliaia di confezioni l'anno, l'errore di un centesimo nella quota o nell'IVA diventa una cifra.

Uno scontrino misto

Un cliente acquista un medicinale da 11 euro e una crema da 22 euro soggetta all'aliquota ordinaria. Nel medicinale ci sono 10 euro di imponibile e 1 euro di IVA; nella crema 18,03 euro di imponibile e 3,97 euro di IVA.

Gli errori più costosi in una farmacia

1. Socio incompatibile: un medico, un informatore scientifico, un dipendente, il collaboratore di un'altra farmacia.
2. Statuto o cambio di soci non comunicati entro 60 giorni agli enti.
3. Oggetto sociale non esclusivo, con attività estranee alla gestione della farmacia.
4. Acquisizioni oltre il 20% delle farmacie della regione, contando le società controllate.
5. Cessione del solo diritto di esercizio senza l'azienda commerciale.
6. Distinta contabilizzata con la logica degli sconti dopo il 1° marzo 2024, o quote fisse trattate come fuori campo IVA.
7. Remunerazione aggiuntiva 2023 considerata detassata.
8. Fatturato SSN calcolato senza la DPC per le soglie delle quote aggiuntive.
9. Scontrino senza codice fiscale e descrizione: il cliente perde la detrazione.
10. Ricette e distinta consegnate in ritardo: l'incasso slitta di un mese.
11. Avviamento ammortizzato fiscalmente più veloce di un diciottesimo.

Come lavoriamo con la tua farmacia

1. Verifica iniziale. Ultime distinte e loro registrazione, IVA sulle quote, compagine sociale e requisiti dei soci, ultimo bilancio.
2. Impostazione. Conti separati per banco, SSN, DPC e farmacia dei servizi; controllo delle soglie di fatturato SSN; calendario delle comunicazioni agli enti.
3. Gestione mensile. Registrazione della distinta, liquidazioni IVA, corrispettivi, F24.
4. Operazioni straordinarie. Ingresso di soci, acquisto di una seconda farmacia, fusioni tra società, vendita: con valutazione, verifica dei limiti e piano fiscale.

Dal 1° gennaio 2027 cambiano i testi di riferimento: il DPR 633/1972 viene sostituito dal Testo unico IVA (D.Lgs. 10/2026) e il TUIR dal nuovo testo unico delle imposte sui redditi (D.Lgs. 117/2026). Le regole su IVA dei farmaci, avviamento e plusvalenze vanno rilette con la nuova numerazione prima di chiudere il bilancio 2026.

Controlliamo la contabilità della tua farmacia

Mandaci le ultime distinte, l'ultimo bilancio e l'elenco dei soci. Ti diciamo se remunerazione e IVA sono registrate correttamente e se la compagine rispetta i requisiti di legge.

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